Question-réponse
ArrĂȘt maladie d'un agent public pendant ses congĂ©s : quelles sont les rĂšgles ?
Vérifié le 13/08/2026 - Service Public / Direction de l'information légale et administrative (Premier ministre)
Un agent public qui tombe malade pendant une pĂ©riode de congĂ© annuel est placĂ© en congĂ© de maladie. En cas dâarrĂȘt de travail prolongĂ©, les congĂ©s annuels non pris en raison du congĂ© pour raison de santĂ© peuvent ĂȘtre reportĂ©s. Nous vous prĂ©sentons les conditions de ce report.
Si vous ĂȘtes malade pendant une pĂ©riode de congĂ©s annuels, vous ĂȘtes placĂ© en congĂ© de maladie sur prĂ©sentation dâun arrĂȘt de travail Ă©tabli par un mĂ©decin, un chirurgien-dentiste ou une sage-femme.
Le congé de maladie annule le congé annuel.
Les jours de congĂ© annuel annulĂ©s peuvent ĂȘtre pris Ă une date ultĂ©rieure.
Les congĂ©s annuels doivent ĂȘtre pris entre le 1er janvier et le 31 dĂ©cembre. Toutefois, lorsque vous ne pouvez pas prendre tout ou partie de vos congĂ©s annuels en raison de congĂ©s pour raison de santĂ©, vous avez droit au report automatique de vos congĂ©s annuels restant dus sur une pĂ©riode de 15 mois.
La pĂ©riode de 15 mois peut ĂȘtre prolongĂ©e sur autorisation exceptionnelle de votre chef de service
Les congés pour raison de santé ouvrant droit au report sont les suivants :
- CongĂ©s de maladie, de longue maladie (CLM) ou de longue durĂ©e (CLD), congĂ© pour invaliditĂ© temporaire imputable au service (Citis), disponibilitĂ© dâoffice pour raison de santĂ© si vous ĂȘtes fonctionnaire
- CongĂ©s de maladie ou de grave maladie, congĂ© pour accident du travail ou maladie professionnelle, congĂ© de maladie non rĂ©munĂ©rĂ© si vous ĂȘtes contractuel.
Rappel
Rappel
Vous nâacquĂ©rez pas de congĂ© annuel pendant une disponibilitĂ© dâoffice pour raison de santĂ© ou un congĂ© de maladie non rĂ©munĂ©rĂ©.
Dans le mois qui suit la date de reprise de vos fonctions, votre administration employeur vous informe, par tout moyen permettant de dater cette information de maniÚre certaine, du nombre de jours de congé annuel reportés et de la date jusqu'à laquelle vous pouvez les prendre.
Les congĂ©s annuels qui peuvent ĂȘtre reportĂ©s sont les congĂ©s acquis avant la mise en congĂ© pour raison de santĂ© et les congĂ©s acquis pendant le congĂ© pour raison de santĂ© ou le congĂ© liĂ© aux responsabilitĂ©s parentales ou familiales.
La pĂ©riode de report de 15 mois dĂ©bute Ă la date Ă laquelle vous recevez lâinformation sur le nombre de jours reportĂ©s et la date limite pour les prendre.
La pĂ©riode de report de 15 mois des jours de congĂ© annuel acquis pendant un congĂ© pour raison de santĂ© dĂ©bute au plus tard Ă la fin de l'annĂ©e pour laquelle le congĂ© annuel est dĂ» si, Ă cette date, vous bĂ©nĂ©ficiez de ce congĂ© depuis au moins 1 an. Dans ce cas, lors de votre reprise de fonctions, la pĂ©riode de report de 15 mois, si elle est pas terminĂ©e, est suspendue jusqu'Ă ce que vous ayez reçu lâinformation sur le nombre de jours reportĂ©s et la date limite pour les prendre.
Le nombre de jours de congĂ©s annuels qui peuvent ĂȘtre reportĂ©s est limitĂ© Ă 4 semaines.
Si vous ne prenez pas les congés reportés dans la période impartie, ils sont perdus et ne donnent lieu à aucune indemnité compensatrice, sauf en cas de départ définitif de la fonction publique.
Si vous ĂȘtes absent sur plusieurs annĂ©es consĂ©cutives, les congĂ©s non pris Ă la fin de chaque pĂ©riode de report de 15 mois sont perdus.
Lorsque vous quittez la fonction publique, quel quâen soit le motif (retraite, dĂ©mission, fin de contrat,...) et n'avez pas pu prendre tous vos congĂ©s annuels avant votre dĂ©part, ces congĂ©s donnent lieu Ă une indemnitĂ© compensatrice.
La durée des congés annuels non pris qui donnent lieu à indemnité est de 4 semaines maximum.
Votre administration employeur vous informe du nombre de jours de congé annuel non utilisés ou reportés donnant lieu à indemnisation.
Lâindemnisation dâun jour de congĂ© annuel non pris est calculĂ©e de la maniĂšre suivante : (RĂ©munĂ©ration mensuelle brute x 12) / 250.
Le nombre 250 est le nombre moyen de jours ouvrés dans une année.
L'indemnitĂ© compensatrice de congĂ©s annuels est soumise aux mĂȘmes cotisations que votre rĂ©munĂ©ration.
La rémunération mensuelle brute prise en compte pour le calcul de l'indemnité compensatrice de congé annuel est égal à la derniÚre rémunération versée lors de votre dernier mois complet d'exercice effectif de vos fonctions.
Cette rémunération tient compte éventuellement des évolutions de votre situation statutaire ou indemnitaire qui sont intervenues entre la derniÚre date d'exercice effectif de vos fonctions et la date de fin de relation de travail.
Elle comprend le traitement indiciaire, l'indemnité de résidence, le supplément familial de traitement (SFT) et les primes et indemnités.
Toutefois, les éléments de rémunération suivants ne sont pas pris en compte :
- Versements exceptionnels ou occasionnels, notamment liés à l'appréciation individuelle ou collective de la maniÚre de servir
- Remboursement de frais
- Participations au financement des garanties de la protection sociale complémentaire
- Versements exceptionnels ou occasionnels liĂ©s aux indemnitĂ©s relatives aux primo-affectations, aux mobilitĂ©s et aux rĂ©organisations et toutes autres indemnitĂ©s de mĂȘme nature
- Majorations et indexations liées à une affectation outre-mer, lorsque leur versement est interrompu avant la fin de la relation de travail
- Indemnité de résidence à l'étranger lorsque son versement est interrompu avant la fin de la relation de travail
- Indemnités versées en contrepartie d'une activité accessoire et autres indemnités non directement liées à l'emploi
- Versements exceptionnels ou occasionnels de primes et indemnités correspondant à un fait générateur unique
- Indemnités liées à l'organisation du travail et au dépassement effectif du cycle de travail.